У меня для одного заказного проекта требовалось приписывать хвост пакету из keyed MD5 (HMAC-MD5), на принимающей системе хвост проверялся и отрезался, пакет передавался стеку уже без довеска, то есть насколько я понимаю что-то вроде того что у Вас и требуется.
Никаких проблем с исчезновением приписанного digest не наблюдалось, видимо у Вас где-то ошибка или стоит какой-то очень специфический софт с подобным же драйвером, сложно сказать что-то конкретное. Если конечно это повторяется на абсолютно чистых системах, значит что-то действительно сделано неправильно…