Так как DNS указан в config, то весь DNS трафик (через dnscache) идет через тоннель на 1.1.1.1. И DNS трафик браузеров не включенных в AllowedApps тоже (исключение, случаи использования DNS over HTTPS в том же Firefox).
На всякий случай я попробовал такую же конфигурацию с 1.1.1.1 у себя и она работает как ожидалось. Так что описанное поведение для меня выглядит странно, надо бы записать логи и PCAP файлы, посмотреть, что там на уровне сети происходит. Не исключено, что установлен какой-то антивирусный пакет, который встраивается в браузер, и за DNS происходит некий конфликт. Если что-то такое установлено, попробуйте удалить/выключить. Еще попробуйте поменять адрес DNS, на что-то альтернативное (8.8.8.8), посмотреть будет ли разница.